Pitanje:
Kako CpG otoci ostaju nemetilirani?
nico
2011-12-30 16:26:00 UTC
view on stackexchange narkive permalink

U većini genomskih mjesta CpG su uglavnom uvijek metilirani, ali CpG otoci su umjesto toga često nemetilirani. To je povezano s činjenicom da su često povezani s prepisanim genima.

Koje su trenutne teorije o mehanizmima uključenim u ovu preferencijalnu demetilaciju?

Jedan odgovor:
#1
+11
KAM
2011-12-30 17:47:05 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Metilacija se sve više smatra posljedicom aktivnosti gena, a ne regulatornim mehanizmom. Postoje slučajevi u kojima se metilacija kontrolira zbog regulatorne kontrole gena, posebno na poznatom lokusu H19 / Igf2 [ 1] . Evo općenito dobrog nedavnog pregleda [ 2] , imajte na umu da spominju da metilacija DNA ne uzrokuje transkripcijsko utišavanje, a vjerojatno su metilirani promotori vjerojatno više aktivni od nemetiliranih, oni samo stvaraju prigušivačke RNA kada se metiliraju (što rezultira prividnim prigušivanjem). Ovo bi moglo pomoći u objašnjavanju neke priče [ 3] , ali imajte na umu koliko je star taj papir, ali ipak bih rekao da malo ljudi zna za njegovo postojanje. >

Čini se da su iznimka prenosivi elementi [ 4] , ali njihova se kontrola vjerojatno kontrolira i utišavanjem RNA.

Reference:

  1. Zampieri M, Guastafierro T, Calabrese R, Ciccarone F, Bacalini MG, Reale A, Perilli M, Passananti C, Caiafa P . 2012. ADP-ribozni polimeri lokalizirani na kompleksu Ctcf-Parp1-Dnmt1 sprječavaju metilaciju Ctcf ciljnih mjesta. Biokemijski časopis 441: 645–52.

  2. Deaton AM, Bird A . 2011. CpG otoci i regulacija transkripcije. Genes & razvoj 25: 1010–22.

  3. Rountree MR, prodavač EU . 1997. Metilacija DNA inhibira produljenje, ali ne i započinjanje transkripcije u Neurospora crassa. Genes & Development 11: 2383–2395.

  4. Bourc’his D, Bestor TH . 2004. Mejotička katastrofa i reaktivacija retrotranspozona u muškim spolnim stanicama kojima nedostaje Dnmt3L. Priroda 431: 96–9.

Ovo je objavljeno prije samo nekoliko sati (http://www.plosgenetics.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pgen.1002422). Utiskivanje majčinog alela SNRPN (koji je nemetiliran) zahtijeva transkripciju, ponovno naglašavajući da je metilacija posljedica prešutnog prešućivanja, a ne uzročna u utišavanju gena.


Ova pitanja su automatski prevedena s engleskog jezika.Izvorni sadržaj dostupan je na stackexchange-u, što zahvaljujemo na cc by-sa 3.0 licenci pod kojom se distribuira.
Loading...