Pitanje:
Može li siRNA izazvati metilaciju DNA u stanicama sisavaca?
Mad Scientist
2011-12-16 15:00:37 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Prije nekoliko godina Hiroaki Kawasaki i Kazunari Taira objavili su članak pod nazivom "Indukcija metilacije DNA i utišavanje gena kratkim interferirajućim RNA u ljudskim stanicama" u Prirodi:

U biljkama dsRNA ciljane na CpG otoke unutar promotora mogu također inducirati RNA usmjerenu metilaciju DNA 3, 4, 5, 6, 7, 8 ; međutim, ostaje nejasno mogu li dsRNA u stanicama sisavaca inducirati utišavanje gena posredovano metilacijom DNA. Ovdje pokazujemo da kratkodjelujuće RNA (siRNA; molekule 21-25 nukleotidnih RNA) induciraju metilaciju DNA i metilaciju histona H3 u ljudskim stanicama.

Čini se da ovaj rad također pokazuje da siRNA može inducirati dugotrajno ušutkivanje gena metilacijom DNA u stanicama sisavaca, što ranije nije primijećeno. Nažalost, papir je povučen kasnije, što je dovodilo u pitanje rezultate.

Tada mi je papir bio vrlo uzbudljiv, jer je sugerirao mogućnost provođenja genske terapije, za utišavanje specifični geni, samo pomoću RNA interferencije.

Koji je trenutni znanstveni konsenzus ovdje, postoje li uvjerljivi dokazi da je u stanicama sisavaca moguće metiliranje DNA izazvano siRNA? Je li itko mogao ponoviti rezultate Kawasakija i Taire?

Jedan odgovor:
#1
+15
Rik Smith-Unna
2012-02-01 06:05:33 UTC
view on stackexchange narkive permalink

Iz kratkog pregleda literature čini se da je zajednica Kawasakija i Tairu većinom opravdala prije i nakon njihovog rada. Povlačenje je povukla samo Taira, Kawasaki je odbio potpisati jer je smatrao da su podaci valjani. Iz povlačenja čini se da je razlog povlačenja izgubljena laboratorijska knjiga.

Prije rada Kawasakija i Taige, već je bilo nekoliko drugih članaka koji opisuju epigenetsku modifikaciju izazvanu RNAi kod sisavaca:

Zatim je sljedeće godine objavljen još jedan članak Kawasakija & Taira, koji nije povučen:

Čini se da je ideja općenito prihvaćena i podržana u još nekoliko studija, uglavnom promatrajući stanice zametne linije . Na primjer:

Ne bih pronašao nijednu recenziju koja doista sve to uvjerljivo povezuje, ali postoji nekoliko recenzija o RNAi usmjerena modifikacija histona i kromatina općenito koja spominju da je činjenica utvrđena kod sisavaca:

Referenca na zametne stanice (Carmell i sur., 2007.) ne opisuje siRNA, već se bavi potpuno drugačijom klasom malih RNA, nazvanih piRNA (u radu su ih nazivali rasiRNA, ali piRNA je danas često korištena nomenklatura) . Postoje ključne razlike između siRNA i piRNA (raspodjela veličine i proteini s kojima se povezuju) i one se ne smiju miješati.
Pregledavao sam pregled Joshua-Tor-a i Hannona (2010) koji ste naveli i nisam primijetio nijedno spominjanje siRNA-a koje usmjeravaju metilaciju DNA (ili modifikaciju histona) kod sisavaca. Oprostite ako sam propustio, možete li citirati relevantnu rečenicu?
@Sergei u pravu si! Taj rad zapravo spominje metilaciju usmjerenu na piRNA, a ne na siRNA. Ostavit ću to u odgovoru jer je i dalje relevantno za pitanje.


Ova pitanja su automatski prevedena s engleskog jezika.Izvorni sadržaj dostupan je na stackexchange-u, što zahvaljujemo na cc by-sa 3.0 licenci pod kojom se distribuira.
Loading...